一、背景

遺傳多樣性的保護和利用對于當(dāng)前的利用和未來可持續(xù)利用和發(fā)展的需求都很重要。

任何育種計劃都基于物種遺傳資源的可用性，還包括相關(guān)物種和一般物種。任何種質(zhì)資源收集和活庫中的基因型數(shù)量都受到空間、勞動力和遺傳資源管理所需的巨額資金的限制。

隨著全球育種計劃的集中努力，大多數(shù)物種每年都會增加數(shù)百個品種，實際上很難將所有種質(zhì)保存在一個地方。育種者和研究人員面臨為育種計劃確定特定類型遺傳多樣性的困難。通常很難找到有關(guān)具有某些感興趣特征的種質(zhì)的信息，例如更高的產(chǎn)量、對生物或非生物脅迫的抗性等。因此，種質(zhì)信息的記錄和編目對于正確保存和利用種質(zhì)是必要的。

挖掘種質(zhì)信息對于了解作物多樣性及其有效利用以維持豐富的生產(chǎn)和健康的環(huán)境也是必要的。

二、功能示范

當(dāng)前世界上已有各種研究人員已經(jīng)開發(fā)了許多種質(zhì)資源庫，即 Horry 等人 (2002) 在菠蘿中； Rajagopal 等人 (2005) 在椰子中； Upadhyaya 等人 (2007) 在珍珠小米； Savita 和 Hussain（2009 年）在大豆中； Singh 等人（2013 年）在香蕉中； Praveen 等人 (2015) 在甘蔗中。

從中學(xué)習(xí)優(yōu)秀的經(jīng)驗，對開發(fā)使用自己的系統(tǒng)很有必要。下面本文將以印度的玫瑰基因資源庫系統(tǒng)為例。

ICAR - 印度園藝研究所 (ICAR-IIHR) 在過去 5 年中長期從事主要園藝作物種質(zhì)的收集、保存和改良工作。

這項研究有兩個主要目標
（i）建立玫瑰基因型的數(shù)字存儲庫和
（ii）開發(fā)支持網(wǎng)絡(luò)的界面以檢索有關(guān)玫瑰及其所需基因型的基本信息。

ICAR-IIHR 位于班加羅爾的 Hesa??raghatta（北緯 13°08’，東經(jīng) 77°29’，海拔 767 米）。天氣溫和，土壤呈紅色。 ICAR-IIHR 的玫瑰種質(zhì)收集包括 320 種不同類別的基因型。該系列包括本土和外來品種，其中大部分屬于羅莎雜交品種。它包括混合茶、Floribunda、漫步者和登山者的園藝類別。 ICAR-IIHR 正在維護 13 種不同的玫瑰。在本研究模型中，基因型根據(jù)效用（香型、切花和噴霧型散花）進行分類，重點關(guān)注農(nóng)民需求的遺傳改良。

種質(zhì)資源收集的表征描述符基于印度政府植物品種和農(nóng)民權(quán)利保護局 (PPV&FRA) 在獨特性、一致性和穩(wěn)定性測試實施指南 (DUS) 中規(guī)定的 60 個描述符) 用于建立基因型的唯一性。描述符由 17 個植物性狀和 43 個生殖性狀組成。營養(yǎng)性狀中，葉性狀9個，莖性狀8個，而花性狀41個，果實性狀2個。因此，種質(zhì)收集通過其護照數(shù)據(jù)進行認證；我們已經(jīng)在我們的信息系統(tǒng)中包含了相同的內(nèi)容。每個字符都有一個用文字解釋的狀態(tài)列表，每個狀態(tài)由一個整數(shù)代碼表示。

該信息系統(tǒng)是在Windows操作系統(tǒng)的WampServer 2.5虛擬主機平臺上開發(fā)的。后端數(shù)據(jù)庫是在 MySQL 關(guān)系數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng) (RDBMS) 中開發(fā)的，它由 62 個表組成——一張用于護照數(shù)據(jù)，一張用于特征數(shù)據(jù)，其余用于各種其他字符。描述符和護照數(shù)據(jù)收集在 Excel 文件中，并使用 phpMyAdmin 管理工具導(dǎo)入數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫的基于 Web 的用戶界面是用超文本標記語言 (HTML) 和超文本預(yù)處理器 (PHP) 語言開發(fā)的。 PHP 的 mysqli 擴展應(yīng)用程序編程接口 (API) 已被選擇用于與 MySQL 數(shù)據(jù)庫服務(wù)器交互。變量使用 POST 方法在搜索和結(jié)果頁面之間傳遞。

三、優(yōu)缺點分析

ICAR-IIHR系統(tǒng)針對玫瑰花展開了育種種質(zhì)的收集與分析、管理。

但是該系統(tǒng)只針對一個物種的種質(zhì)，仍存在一定的局限性。

且系統(tǒng)開發(fā)流程過于簡單，只是本機的數(shù)據(jù)庫開發(fā)，沒有利用云技術(shù)，因此缺少了諸多的便利，低代碼平臺+定制的方案或許是一個更好的解決方案。

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